Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln8Q9QUK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cln8Q9QUK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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