Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoaQ9QUI0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms