Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2bQ9JME9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2bQ9JME9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms