Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pias4Q9JM05 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms