Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col5a3Q9JLI2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col5a3Q9JLI2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms