Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm1Q9JLF6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms