Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CtsmQ9JL96 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CtsmQ9JL96 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsmQ9JL96 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms