Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gde1Q9JL56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms