Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms