Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Irx5Q9JKQ4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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