Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nova1Q9JKN6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nova1Q9JKN6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms