Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms