Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms