Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem3Q9JKE1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms