Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ybx3Q9JKB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ybx3Q9JKB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms