Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms