Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pard6bQ9JK83 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms