Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msgn1Q9JK54 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Msgn1Q9JK54 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms