Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms