Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gfra4Q9JJT2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms