Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl28Q9JIL2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl28Q9JIL2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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