Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RabggtaQ9JHK4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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