Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tcirg1Q9JHF5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tcirg1Q9JHF5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms