Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PalldQ9ET54 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PalldQ9ET54 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms