Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hapln2Q9ESM3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms