Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rb1cc1Q9ESK9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms