Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmtm7Q9ESD6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms