Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Usp29Q9ES63 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp29Q9ES63 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp29Q9ES63 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp29Q9ES63 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp29Q9ES63 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms