Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc4Q9ES56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc4Q9ES56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms