Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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