Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyp3a44Q9EQW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms