Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a2Q9EQR4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a2Q9EQR4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms