Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf8Q9EQH4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf8Q9EQH4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf8Q9EQH4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf8Q9EQH4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms