Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SgshQ9EQ08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms