Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms