Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn1Q9EPL2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms