Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms