Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnft1Q9DCN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms