Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PmpcaQ9DC61 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmpcaQ9DC61 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms