Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc46a3Q9DC26 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms