Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx6Q9DBY5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms