Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf6Q9DBU5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf6Q9DBU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms