Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SrpraQ9DBG7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms