Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph3bQ9DA80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph3bQ9DA80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms