Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifrd2Q9D8U0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms