Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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