Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tvp23bQ9D8T4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tvp23bQ9D8T4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms