Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rexo2Q9D8S4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms