Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chmp4bQ9D8B3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms