Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk3bl1Q9D701 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3bl1Q9D701 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms